多通道活細(xì)胞成像注意事項(xiàng)
同時(shí)多色成像,確保實(shí)驗(yàn)成功

活細(xì)胞成像實(shí)驗(yàn)是了解動態(tài)過程的關(guān)鍵。這類實(shí)驗(yàn)使我們能夠觀察記錄活體狀態(tài)下的細(xì)胞,而不會可能因固定或終止不同活體過程而產(chǎn)生干擾性偽影。
通過活細(xì)胞成像可以觀察細(xì)胞、組織或整個生物體在其自然環(huán)境中的動態(tài)過程,而不僅僅是獲得終點(diǎn)圖像和數(shù)據(jù)。例如,您可以研究細(xì)胞或蛋白質(zhì)的共定位,以查看不同的靶點(diǎn)是否彼此相鄰,并觀察它們?nèi)绾蜗嗷プ饔谩?/p>
為什么使用多個熒光標(biāo)記很重要?
在活細(xì)胞顯微成像中使用多通道方法可以同步觀察多個細(xì)胞結(jié)構(gòu)和過程,提供生理學(xué)方面更重要的結(jié)果,從而為測量數(shù)據(jù)增加相關(guān)信息。通過這種方法可以研究細(xì)胞與蛋白質(zhì)相互作用、動態(tài)變化以及這些變化如何相互作用和影響。不過,使用單個熒光團(tuán)的實(shí)驗(yàn)很常見,而使用兩個或多個熒光探針對活細(xì)胞成像可能會很復(fù)雜,并且必須仔細(xì)考慮幾個要點(diǎn)才能成功。本文將介紹有關(guān)成功設(shè)置多色活細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的一些關(guān)鍵方面。
選擇合適的熒光團(tuán)
設(shè)置多色活細(xì)胞實(shí)驗(yàn)時(shí),首先要選擇合適的熒光團(tuán),這一點(diǎn)至關(guān)重要。熒光團(tuán)必須與活體樣本相容,并具有光穩(wěn)定性,才能進(jìn)行長期成像。熒光蛋白標(biāo)記、活細(xì)胞染料、動態(tài)標(biāo)記(如 Ca2+ 指示劑)及其他用于標(biāo)記感興趣靶標(biāo)的方法是達(dá)到這類目的的合適工具。但是,由于發(fā)射光譜寬,以多通道方式研究活細(xì)胞過程時(shí)可供選擇的熒光染料仍然相當(dāng)有限。每使用一個額外的標(biāo)簽,找到具有高特異性和高信號輸出的激發(fā)/探測模式就變得更加困難。將兩個或多個熒光團(tuán)信號一起成像時(shí),需要使用復(fù)雜的標(biāo)記策略最大程度減少光譜重疊。
在生理?xiàng)l件下成像
無論使用細(xì)胞培養(yǎng)物、類器官、球狀體還是較小的模式生物,都必須使用近生理?xiàng)l件來確保樣本保持活力。在延時(shí)實(shí)驗(yàn)中,某些條件必須保持最佳狀態(tài),才能確保細(xì)胞不僅能夠存活,而且不會承受壓力,并保持真實(shí)的生理機(jī)能。通常情況下使用培養(yǎng)箱(37°C、二氧化碳、濕度,有時(shí)還包括在一段時(shí)間內(nèi)具有高穩(wěn)定性的氧氣)確保持續(xù)提供近生理?xiàng)l件。此外,選擇一種低自發(fā)熒光、不會干擾信號且不影響成像的介質(zhì)也大有好處。
圖像采集注意事項(xiàng)
寬場顯微成像通常是活細(xì)胞成像的首選,因?yàn)樗軌蚋?、更溫和地成像?/span>最先進(jìn)的寬場顯微成像使用 LED 光源和濾光片組。盡管有很多濾光片都可以用于各種不同的熒光團(tuán)組合,但是為了獲得用多個熒光團(tuán)標(biāo)記的樣本的正確圖像,需要考慮多個因素。
大多數(shù)用于活細(xì)胞成像的熒光團(tuán)都具有寬發(fā)射光譜。這一事實(shí)通常意味著各個探測通道之間會出現(xiàn)串?dāng)_現(xiàn)象,例如,您會在紅色探測通道中看到來自綠色通道的一些發(fā)射光。在活細(xì)胞成像實(shí)驗(yàn)中使用多個標(biāo)記時(shí),熒光光譜重疊現(xiàn)象很常見,因此為了確??吹较胱R別的細(xì)節(jié),可以使用窄帶濾光片。但是,這種方法會導(dǎo)致靈敏度下降并影響結(jié)果,因?yàn)榛罴?xì)胞中的熒光團(tuán)信號水平通常較低,尤其是對于靶標(biāo)豐度稀疏的樣本或以內(nèi)源性水平表達(dá)的樣本。使用更多激發(fā)光來抵消靈敏度下降通常不可行,因?yàn)檫@種方法對樣本的危害性會增加(即光毒性增加)。
在活細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,高速采集通常至關(guān)重要,特別是在研究快速動態(tài)過程時(shí),如囊泡觀察。使用濾光片會導(dǎo)致速度受限,因?yàn)樵诟淖兠糠N顏色的濾光片組時(shí)必須依次成像。按順序采集圖像比同時(shí)采集圖像需要更多時(shí)間,因此在采集過程中可能會錯過樣本的快速運(yùn)動,因?yàn)閺囊粋€圖像到下一個圖像時(shí)每種顏色都有更長的時(shí)間間隔。此外,當(dāng)兩種或多種顏色之間的直接比較至關(guān)重要時(shí),例如在上述囊泡觀察實(shí)驗(yàn)中:信號甚至可能在兩次熒光團(tuán)采集之間已經(jīng)移動,從而加大數(shù)據(jù)解釋的難度。
改善活細(xì)胞成像的替代方案
研究活細(xì)胞中多個探針之間的相互作用而獲得的大量信息可提供生理學(xué)方面更重要的結(jié)果,因此人們開發(fā)了多種方法來拆分復(fù)雜的混合發(fā)射光信號。
為了能夠使用多個標(biāo)簽,以便從一個樣本中獲得更深入的認(rèn)識,您可以使用光譜圖像信息線性拆分方法,它可以分析每個熒光團(tuán)對總信號的貢獻(xiàn)。要進(jìn)行線性光譜拆分,必須為所有可能的參考光譜混合方式計(jì)算未知光譜與參考光譜之間的最小差值 (1)。這種方法通常用于對多種顏色成像,即使它們重疊。但是在寬場顯微成像中,您仍可能遺漏關(guān)鍵信息,因?yàn)楸仨殞颖局忻總€熒光團(tuán)依次成像,這會導(dǎo)致速度受限。
如果采用其他方法會怎樣?
有一種方法可以快速拆分多種顏色,而不必?fù)?dān)心采集期間光譜重疊,也無需學(xué)習(xí)復(fù)雜的光譜拆分方法。
最近發(fā)表的一些文章介紹了一種基于相量的光譜拆分方法 (2, 3)。光譜相量分析可將每個像素的光譜成分轉(zhuǎn)換為二維圖中的一個位置。這樣就可以利用簡單的數(shù)學(xué)方法即時(shí)、可靠地分離不同染料的發(fā)射光。此外,它還可以僅基于光譜而不是強(qiáng)度來增加濾光——從而保留圖像的細(xì)微細(xì)節(jié),同時(shí)減少可能會影響線性光譜拆分的噪聲。由于實(shí)際上消除了串?dāng)_以及自發(fā)熒光等干擾因素,選擇合適的熒光探針組合不再是問題,因此以這種方式成像可以更輕松地設(shè)置多通道活細(xì)胞成像實(shí)驗(yàn)。
參考資料:
1.T. Zimmermann,《生物化學(xué)工程進(jìn)展/生物技術(shù)》2005, 95, 245
2.F. Fereidouni、A. N. Bader、H. C. Gerritsen《Opt.Express》2012, 20, 12729。
3.Francesco Cutrale、Vikas Trivedi、Le A Trinh、Chi-Li Chiu、John M Choi、Marcela S Artiga 和 Scott E Fraser,高光譜相量分析可實(shí)現(xiàn)多通道 5D 體內(nèi)成像, 《自然·方法學(xué)》14, 149–152 (2017) doi:10.1038/nmeth.4134